创建期间，在光绪二十年(公元1894年)中日甲午战争时间，发生了台湾割让给日本，第二年日军进占台湾，开始了日据时期的年代。至光绪三十三年(公元1907年)日本人为建立日语学校，故将孔庙拆除，并在此建立了第一高等女子学校。
　　到了民国十四年(公元1925年)，台北士绅黄赞钧、陈培根、辜显荣等人再次邀请及募款建庙事宜。于同年二月成立台北圣庙建设筹备处，共募集约五千坪作为孔庙的建筑基地。1951年，织台北孔子庙管理委员会，推动每年祭典事宜。至1971年，经行政院核交台北市政府接管，并于1972年，正式成立台北市孔庙管理委员会，隶属民政局。
台北孔庙采曲阜本庙建筑，梁柱门窗皆未刻字显得朴实又庄严。孔庙的特征凸显建筑艺术，其布局依序为万仞官墙(酒泉街上照墙)泮池、檽星门、仪门、大成殿及崇圣祠；墙的典故出自论语为孔庙必备。传说是表示没人敢在孔老夫子门前卖弄文章。
　　台北孔庙中也没塑像；原因来自明太祖下令以牌位取代(因雕刻技术不同，无法表现孔子神态)照墙内壁彩绘麒象征“吉祥”。大成殿为主殿，上悬扁额有教无类贯古通今如今也是教育所遵循的最高原则，互古不易的教育爱，所以至圣先师的崇高地位至今无人逾越。
　　台北孔庙每年9月28日都会举办祭孔大典的盛会，祭典从迎神开始，接着行上香礼、三献礼、读祝文、饮福受胙、望燎，最后送神，完成整个祭祀程序。过程中，你可以看见身穿暗紫色的禅衣礼生，陪引主祭正献官等虔敬行礼。
　　祭孔大典其中以遵循明朝古礼，舞者进退疾徐，展现不同仪姿的祭孔佾舞最吸引中外嘉宾观礼；除外，还有那“拔智慧毛”等特别的习俗。

瑄颐 撰文