史继偕出身官僚世家，从小受到良好教育，弱冠即从洪猷学《周易》。

史继偕于万历十三年乙酉（1585年）领乡荐，万历二十年壬辰（1592年）登进士第，殿试一甲二名（榜眼），授编修。

万历二十六年（1598年），史继偕充会试同考官，后奉诏出使粤西，不久升侍读，转中允。丁内艰，停职回家治丧；除服就任，升左谕兼侍读。

万历三十六年（1608年），史继偕请求乞休，三次上疏，均不准。

万历三十七年（1609年），擢南祭酒；不久，推为南吏部侍郎，摄尚书事，署户、礼、工三部。

万历三十九年（1611年），署都察院，后改礼部侍郎，协理詹事府，又受推为吏部右侍郎兼翰林院侍读学士。史继偕三次提出辞职，都不获允许，于是从命到京就任视事，仍兼掌尚书事。

神宗万历末期，朝廷昏暗，吏治腐败，官场废弛，天灾倭患，边境告急，内外交乱，国无宁日，民不聊生。而神宗深居禁中，一切命将请兵疏奏皆不报。当时，内有魏忠贤所指挥，傍有客氏为之操纵，蚁附蝇集，千方百计驱除善类。在这种情况下，史继偕仍对朱明王朝耿耿忠心。

万历四十六年（1618年），时内阁止一人，尚书止四人，侍郎止四人，科臣止七人，台臣在京者止十人。史继偕因才高政廉，曾一度署户、礼、工三部，力清盘库盗帑积弊；署都察院时，严加稽覆弊端；任吏部右侍郎时，对官员的考察，以训廉为主。种种等等，对一批官吏降黜，免不了引起忌恨。

万历四十七年（1619年）二月，史继偕授为会试正考官，取庄际昌等三百五十名进士及第出身，

三月，与大学士方从哲、户部张问达同为殿试读卷官。取庄际昌为一甲一名（状元）。由于庄际昌进呈卷第三行刮补数字，又误写“醪”字为“膠”字。庄际昌与史继偕同为晋江人，因而朝廷内外舆论大哗，恶意攻击，认为史继偕作弊偏袒，私其门人，发出“鼎甲可以市恩”的责问。

其实，庄际昌进呈卷的讹字的问题，责任并不全在史继偕。因当时殿试读卷官总裁是宰首方从哲，再说状元又是神宗亲点的，容不了史继偕作弊，且方从哲承认进卷失详，恳恩认罪，得到神宗的宽解，认为“简税失详，既引罪，姑宥之”。

七月，辽阳经略杨镐告急，神宗竟以病为借口，不予临朝。史继偕与赵焕会九卿科道请帝视朝，召见廷臣议方略，跪候至晚还搬请不动。朝官努力无效，纷纷疏辞离朝，朝廷出现瘫痪局面。

史继偕也辞朝南行，至浙江接邸报，升东阁大学士。时神宗已驾崩。史继偕回到泉州，又上疏乞休，仍然得不到批准。

天启元年（1621年）六月，朝廷差官赴泉州催促，要史继偕马上到京视事。当他到京上任才近一个月的时间，就被加封太子太保兼文渊阁大学士（宰相）。

天启二年（1622年），史继偕与叶向高等被熹宗命为神宗、光宗两朝《实录》总裁。

天启三年（1623年）三月，先是有朝臣诬陷史继偕的儿子在海上掠货。对此，熹宗知“共谬”，不报。

继之，吏部右给事中阮大铖捕风掠影，接枝添叶，诬告说：“泉州有一钱会，盖人醵钱一文以聚众也。风闻辅臣史继偕子史八舍，阴为盟主。乞谕抚按官，凡邪会异教，预行禁止；其已经发觉者，务根究正罪如律。”史继偕具疏陈辨：“臣一见科臣阮大铖疏，不胜惭愧。臣子在籍，臣乡府县监司具在，事若有端，便要严是鞫审，仍趁抚按。”

阮大铖攻讪愈剧，史继偕也不断力求乞归，月具数本，而被熹宗不断卫护慰留，直至天启三年（1623年）七月，史继偕一共上了十八疏，才被熹宗恩准，诏许给驿归，仍加少保，荫一子为中书舍人，并赐银币，遣官护行。同年同月，改荫史继偕长子史遵灏中书舍人，中男史延旭补前荫。

史继偕致仕在家，正遇东南沿海海衅此起彼落，海贼、倭寇、红夷虎视眈眈，合力为患。史继偕不遗余力，询之荐绅父老，日夜操心泉州海防设施。

史继偕确定在车桥之下，浯屿之上，地名鹧鸪口，为郡东南门户。这里海洋多暗礁伏石，非潮涨巨舟不得引行，寇至港门，列炮齐发，一夫之守，雄于万人。天启七年（1627年），知府王猷和司理宣城唐侯两人，自出俸赀，共举大役，在“靡借于公帑，亦弗渔闾右一钱”的情况下，如期诹吉鸠工。

崇祯二年（1629年），史继偕还与另一位泉州知府蔡善继议建溜石铳台，并在很短的期间内建成，并为其作记。

史继偕辞职家居，在对望石鼓山下的怡云野筑，潜心著述及整理文献，所著有《云台藏稿》十六卷、《奏议》四卷、《八闽人物》四卷、《太史一家》一卷、《越章录》四卷、《怡云草》一卷。

崇祯八年（1635年）二月，史继偕卒，享年七十五岁。墓在晋江磁灶驷行山铺烛台。加赠少师兼太子太师，谥文简，赐祭葬；又追赠左柱国太师兼太子太师，特晋光禄大夫礼部尚书文渊阁大学士。

附：

史继偕曾游罗浮山（罗浮山位于 广东省博罗县，亦称东樵山），其《石洞山房》云：“劈石齐通径，环山曲抱村。天遗知白谷，从道草玄门”。

史继偕为阮大钺所排挤，引疾致仕，“屡盘桓武夷，有吟咏”，留下不少诗篇。