崇武天后宫建于明永乐年间（1403-1424），那时称天妃宫，民间也称妈祖宫，或称黑脸妈宫。据《崇武所城志·庙祀》载：“天妃宫，在城外西南江口山之下。其神姓林，名默，世居兴化府莆阳之湄洲屿，传曰黄泥港。父林愿，官都巡检，天妃其第六女也，彼地男女长幼通称谓曰：姑娘。降生时为宋建隆元年，三月二十三日辰时，有祥光异香，长能乘席渡海，常乘云游岛屿，人呼曰：龙女。宋雍熙四年（987）九月二十九日升化。后人见朱衣飞行海上。天圣间（1023-1032）立庙于莆之西，赐额曰：‘顺济九天’。元天历二年（1329），加封为‘护国庇民广济福惠明著天妃’。赐庙额曰：‘灵慈’。明永乐七年（1409），中官奉命航海通西南夷，过湄洲有保护功，归上其事于朝，敕封海神宋灵惠夫人林氏为‘护国庇民妙灵昭应弘仁普济天妃’，建祠京师之仪凤门。 崇濒海，舟楫出入，赖其神功，塑像而祀焉。”
　　崇武天后宫只是一弹丸小庙，规制狭小。随崇武港军事战略地位的加强和渔航经济活动的繁荣，天后宫也不断拓展鼎新，终成为濒海之巨观。嘉靖年间，崇武历经一段极其惨烈的倭犯，城池也曾被倭寇占踞40天之久，受到极大的破坏。后经军民奋战，倭犯得以平息。隆庆三年（1569）又大歼入侵倭寇。自此，乡国升平，经济再度振兴，天妃宫也更受人们关注而得到扩展。清顺治十二年（1655）再次修整，并铺门外石埕、石栏，至此，崇武天后宫基本完整定型。
　　崇武人历来备受海神妈祖娘娘的庇佑，崇祀也极其虔诚。清康熙即位时（1662）下令迁海。崇武人被迫背井离乡内迁，仍不忘妈祖的恩德。康熙十九年（1680）撤迁海令，崇武人纷纷返回，重建家园。数年之后，当崇武的渔航业再度发达，经济又繁荣起来时，人们立即想到应该重振天后宫，于是花钱187贯以新后庙。此举得到全崇武渔民及过往商船的大力支持。
　　清代以来，崇武的渔业航商业进一步开发，崇武天后宫的敬祀活动也盛况空前。其时，崇武数十号大渔船，每年冬季至次年初春，合舟宗北上舟山渔场，必迎妈祖神像同往浙江坎门澳护渔。迎来送往，倾城出动，十分隆重。还有那络绎不绝到崇武港停泊的各类船只，也必进天后宫祷祀，以保平安。
　　乾隆五十二年（1787），福康安当时为军机大臣，领兵东渡台湾，因遇狂风，船队停泊崇武港。福亲自到天后宫祷告，在妈祖的庇护下，终于顺利进台湾。后来，乾隆皇帝下旨独敕封崇武的妈祖。乾隆五十六年（1791），兴泉永道还特发禁示、树碑保护崇武天后宫，这是崇武天后宫最为辉煌的历史。
　　1957年3月，一场火灾，崇武天后宫被烧为平地。但是，以海为生的人们并未忘记妈祖娘娘，他们仍以各种方式进行敬祀妈祖。1983年，一批老渔民自发组织了“崇武天后宫重建小组”，开始集资。在各方的大力支持下，先后筹集50多万元，终于让天后宫原貌重放光彩。
　　现在的崇武天后宫金碧辉煌，大门上边有“崇武天后宫”和“圣母古地”匾额。对联曰：浪打石为门古地灵神扶极海，潮平波似练中州圣主驾飞龙。主殿神龛中供奉妈祖神像，上额是乾隆皇帝御书“恬澜昭贶”。庙堂纵深二进，横列六柱，中有拜亭及两侧回廊。庙前有石埕，庙后有花园及甘泉古井。天后宫富丽堂皇，巍峨宽敞。
　　这里供奉的妈祖叫黑脸三妈。这是崇武天后宫的又一独特之处。据说某年一天，崇武一渔人发现这里海边不知从何漂来一根大木头，这渔人把木头捞起，因为太重，扛不动，就暂放进宫里。当他回去叫人来扛时，天色已暗，木头不见了，却见拜亭中的赤石上端坐着一位女神，渔人连忙下跪而后回家。次日，渔人再到天后宫，女神不见了，却见木头在宫里。事情传开后，渔人就请艺匠用这木头雕刻成神像奉祀。因为这里先已有了大妈、二妈塑像，此刚雕的神像就称三妈。三妈神像置于大殿堂案正中，由于长年香火旺盛，三妈的脸不久就被熏黑得油光发亮。
　　三妈的神力在崇武人心目中留有极其深刻的印象。自从三妈神像塑造后，崇武凡有神事活动，天后宫都由三妈参加。每年崇武渔船北上投入生产，必由前一渔汎的一舟宗船携带三妈神像首先启航开路，其他船随后出发。半年的渔汛期，三妈坐镇浙江坎门澳，不但崇武船敬祀，各地进舟山渔场的渔船及坎门一带的居民也都奉为保护神。
　　由于崇武在闽台通航方面的突出地位，崇武天后宫与台湾也具有特殊的关系。在与台湾的交往中，陆续有崇武人留居台湾谋生，他们把妈祖的信仰带进台湾，黑脸三妈也就随之在台湾立庙奉祀，成为台湾民间信仰神灵。现在台湾奉祀黑脸三妈的妈祖庙有50多座。1989年台湾影视界到福建拍摄电视连续剧《妈祖外传》的外景，领衔主演郭美珠女士特地到崇武拜祀黑脸三妈。经郭女士介绍，次年台湾奉祀黑脸三妈的溪北大兴宫特地组团到崇武进香。现在，每年都有台湾的进香团到崇武天后宫，闽台交往越来越密切。

陈宝柱